Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdk16Q04735 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdk16Q04735 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms