Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddr1Q03146 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddr1Q03146 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms