Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NfiaQ02780 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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