Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Muc1Q02496 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms