Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdcd1Q02242 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdcd1Q02242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms