Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp2P97299 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms