Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx2P81066 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx2P81066 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms