Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgif1P70284 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms