Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DccP70211 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DccP70211 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DccP70211 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DccP70211 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DccP70211 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DccP70211 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DccP70211 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DccP70211 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DccP70211 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DccP70211 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DccP70211 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DccP70211 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DccP70211 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DccP70211 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DccP70211 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DccP70211 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DccP70211 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DccP70211 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DccP70211 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DccP70211 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DccP70211 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DccP70211 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DccP70211 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DccP70211 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DccP70211 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DccP70211 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DccP70211 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DccP70211 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DccP70211 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DccP70211 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms