Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sumo1P63166 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sumo1P63166 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms