Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp2P63044 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms