Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnb1P62874 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms