Protein–RNA interactions for Protein: P62827

Ran, GTP-binding nuclear protein Ran, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RanP62827 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RanP62827 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RanP62827 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RanP62827 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RanP62827 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RanP62827 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RanP62827 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RanP62827 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RanP62827 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RanP62827 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RanP62827 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms