Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r1P61809 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5r1P61809 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms