Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf13P61216 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms