Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5bP61021 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms