Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sem1P60897 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms