Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl8P59280 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klhl8P59280 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl8P59280 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms