Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33bP59016 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33bP59016 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms