Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FusP56959 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FusP56959 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FusP56959 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FusP56959 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FusP56959 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FusP56959 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FusP56959 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FusP56959 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FusP56959 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms