Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrr1P56475 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms