Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cks2P56390 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms