Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GferP56213 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GferP56213 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GferP56213 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GferP56213 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GferP56213 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GferP56213 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GferP56213 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GferP56213 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GferP56213 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GferP56213 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GferP56213 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms