Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rad23bP54728 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad23bP54728 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms