Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab2aP53994 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms