Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms