Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efnb1P52795 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms