Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna7P49582 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms