Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd1P48410 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcd1P48410 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd1P48410 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms