Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfx1P48377 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms