Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syt1P46096 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt1P46096 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt1P46096 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms