Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LtbP41155 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LtbP41155 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtbP41155 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtbP41155 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtbP41155 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtbP41155 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LtbP41155 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtbP41155 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtbP41155 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtbP41155 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LtbP41155 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtbP41155 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbP41155 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LtbP41155 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbP41155 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbP41155 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbP41155 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbP41155 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms