Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpl28P41105 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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