Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csf3rP40223 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csf3rP40223 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms