Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hes1P35428 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hes1P35428 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hes1P35428 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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