Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TpoP35419 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TpoP35419 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TpoP35419 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TpoP35419 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TpoP35419 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TpoP35419 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TpoP35419 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TpoP35419 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TpoP35419 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TpoP35419 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TpoP35419 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TpoP35419 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms