Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd22P35329 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd22P35329 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd22P35329 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms