Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab5cP35278 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rab5cP35278 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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