Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd10P28359 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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