Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PparaP23204 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PparaP23204 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PparaP23204 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PparaP23204 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PparaP23204 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PparaP23204 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PparaP23204 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PparaP23204 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PparaP23204 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PparaP23204 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PparaP23204 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PparaP23204 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PparaP23204 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PparaP23204 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms