Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ntf3P20181 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms