Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rps6ka1P18653 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps6ka1P18653 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms