Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18529 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18529 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18529 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18529 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18529 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18529 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18529 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18529 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms