Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18526 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18526 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18526 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18526 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18526 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18526 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18526 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18526 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18526 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18526 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18526 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms