Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD44P16070 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD44P16070 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD44P16070 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD44P16070 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD44P16070 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD44P16070 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD44P16070 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD44P16070 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD44P16070 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD44P16070 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms