Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd8bP10300 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd8bP10300 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms