Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl1P10146 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl1P10146 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl1P10146 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl1P10146 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl1P10146 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl1P10146 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms