Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ndufb1P0DN34 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ndufb1P0DN34 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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