Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms