Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxa1P09022 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms